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第三十一集
宝取出六本经书，将内藏的羊皮全部取出，又将假羊皮放入。其后，康亲王找小宝商量仿制经书，好向康熙交差，小宝於是做个顺水人情。事成后送小宝一座子爵府作谢礼，小宝大喜。九难决随小宝往云南。
小宝护送建宁到云南途中被建宁用蒙汗药迷倒，醒后发觉赤身被公主困绑及施以酷刑，九难为救小宝掷阿珂入房，阿珂掩面救小宝后离去。
小宝松绑后还击，建宁施媚功求饶，小宝终受不住引诱与建宁一夕风流。建宁要胁小宝杀应熊，小宝敷衍答应。
第三十二集
小宝到云南后见三桂，明知故问地戏弄三桂一番，并乘机敲诈一笔。
小宝命天川、玄贞二人查探溢之下落，发现溢之已被三桂割去四肢、双眼及舌头，以免他泄露谋反一事，小宝大怒。另外，天川等人掳来蒙古使者罕帖摩，小宝探出三桂联合蒙古、西藏，罗刹国及神龙教，四路夹击谋反。
小宝趁游逛平西王府时，对府内各陈设加以批评，暗示三桂谋反之心，三桂再动杀机。小宝在书房无意中发现暗格，乘机将内藏的正蓝旗四十二章经掉包。应熊借救火之名搜罕帖摩，小宝将计就计。
第三十三集
三桂为应熊冒犯建宁一事张罗，却发现原来应熊被阉乃建宁阴谋，誓要报仇。
小宝得知阿珂行刺三桂被擒，向九难求救，被拒绝。小宝藉词探望叁桂，後又要见刺客。小宝赫然发现被囚禁的竟是剑屏，遂使计将剑屏带走。
剑屏忆述离开神龙岛后，再遇剑声、大洪等人，正商量对付吴三桂之计时，却被三桂手下擒获。至此，小宝知已中三桂圈套。
三桂安排一舟揭穿小宝计谋，小宝机智地应付过去。小宝接到救阿珂的字条赶往，原来接见小宝的正是陈圆圆。圆圆道出自己的过去及阿珂的身世，小宝庆幸阿珂乃三桂女儿，应可保命。
第三十四集
三桂布下重兵围捕小宝等人，九难出现解困。三桂与自成决斗时将圆圆劈伤，幸九难及时制住。小宝以三桂交换阿珂等人质，再“请”应熊陪同返京。小宝与各人分道扬镳至一小镇，得一艳丽寡妇招呼，小宝心神荡漾。原来是三桂设下陷阱，幸得曾柔及时相救。
三桂逼圆圆自行了断，自成不惜冒险抢救圆圆，逃走中在破庙遇到阿珂，被她痛骂且不肯相认，追兵至，自成牺牲自己救阿珂，圆圆看见自成已死亦自杀身亡，阿珂大受刺激，把一切不如意事情全部推到小宝身上，并发誓要将小宝置于死地。
第三十五集
阿珂、克爽和冯锡范在赌场伏击小宝，幸得双儿及吴六奇相救，小宝六奇重遇，互相印象改观变成好友。
瘦头陀遇到自己亲生女儿建宁公主也不能相认，还要向她下跪请安，心中不是味儿。
小宝进入一间妓院寻欢作乐，原来这间妓院是天地会的柳州分舵，小宝遇到师父陈近南。吴六奇与双儿投契结为谊兄妹，而近南冒着生命危险到台湾拜见郑王爷，小宝告诉师父有关四十二章经的秘密，希望阻止他去台湾，但近南坚持，小宝依依不舍。
第三十六集
九难知小宝并不是练武人才，于是传授“神行百变”的轻功，同时吩咐他要善待阿珂。
康熙借助外国人的科技，成功制造出大炮，并下令小宝歼灭神龙教。
双儿成功把藏宝地图砌成，藏宝地点就在关外的鹿鼎山。
施琅善打海战，小宝知人善用，向康熙徵用施琅去攻打神龙岛。小宝从水中救起瘦头陀，知道神龙教发生内讧，于是小宝以通吃岛为军事基地作指挥，把神龙教打得落花流水。
第三十七集
苏荃以方怡做鱼饵，活捉小宝，幸好被双儿救出脱险，二人逃到关外，看到罗刹人杀害村民，非常气愤。
小宝误入罗刹人的城堡，偷听到神龙教教主与罗刹人密谋作乱，要从天津攻打大清，令到小宝非常担心康熙的安危。
小宝在密室中遇上罗刹国的公主苏菲亚，而小宝当清朝大官的身分亦被洪教主揭穿。
小宝以口甜舌滑，骗得罗刹公主信任，洪教主不忿离去。罗刹沙皇驾崩，苏菲亚被软禁不得回国。
第三十八集
小宝略施小计，令苏菲亚回国并做了摄政王，小宝玉成罗刹国与大清建立的邦交，从此两国互不侵犯。小宝再立下大功，被册封为一等忠勇伯。
三藩再次上书要求削藩，吴三桂目的是藉着削藩而起兵作乱，康熙知道便与小宝串谋，令朝中大臣因吴三桂密谋作反而赞成削藩。
康熙为了令老百姓心悦臣服，于是派小宝去扬州建忠烈祠；另外，为了削弱吴三桂旧部属重投怀抱，要小宝派兵围剿王屋派，小宝找来赵良楝献策，欲七擒七纵王屋派。
第三十九集
吴应熊想骑云南飞马逃离京城，于是与小宝打赌赛马，小宝为了取胜给飞马吃了巴豆，令到飞马肚泻不能奔驰，错有错着地把应熊活捉，令吴三桂不敢轻举妄动。
小宝到王屋山，希望劝服司徒伯雷答应假降满清，不过，吴三桂早一步派了巴朗星招揽伯雷助他消灭大清，然后自己做皇帝，伯雷不从被杀。
小宝到扬州建忠烈祠，见吴之荣当了扬州知府，暗中盘算如何捉他去见庄家少奶。
第四十集
小宝回到丽春院见春花，巧遇克爽与阿珂，原来二人约了桑结与葛尔丹共谋造反。小宝使计迷倒二人，又化解了与桑与二人的恩怨，且三人结拜成兄弟。
苏荃率众来擒小宝，反被他迷倒。苏荃、阿珂、方怡、剑屏、曾柔、双儿六女云集丽春院，小宝大喜，与她们大被同眠。事后，阿珂宁死不屈，小宝伤心地让她与克爽回台湾。双儿为了安慰小宝，特意去买汾酒牛肉给他吃，赫然见吴之荣押解犯人经过。
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